国务院总理朱镕基在《政府工作报告》中说：今年要按照中央确定的方针，积极、稳妥地推进地方政府机构改革。
省级政府机构设置要注意与国务院机构相对口，人员编制原则上减一半。为稳妥起见，县级和乡镇政府的机构改革放在明年进行。
朱镕基指出，地方政府机构改革要精心组织，周密部署，深入细致地做好人员分流工作，做到思想不散，秩序不乱，工作正常运转。
政府机构改革正在向深度推进，各省情况如何？
人大代表、河北省委书记叶连松说，“河北省政府今年开始进行机构改革，省一级现在正在制定方案，大体上机构设置和国务院对口，人员目标也要减少一半。”“政府对企业不再直接管理，该下放的要下放，要加强政府自身应有的职能，政府还要加强宏观监管。”
广东省省长卢瑞华说，广东今年的第一项改革就是政府机构改革，将从原有的57个政府机构压缩到40个，人员编制减少一半，计划在9月份之前完成，年底完成市级政府机构改革，明年初开始县、镇级政府的改革。
福建省是率先列出政府机构改革日程表的省份。省、地（市）两极机构改革今年将同步进行，先行一步；县、乡级机构改革将在明年展开。这次改革，省、地级机关将有半数人员被分流。为保证改革顺利进行，该省制定了鼓励干部从机关向企业流动、办私营企业的政策。
四川省朱盛科、樊世英代表建议，对省级机构改革应加上时间限定。在全国有2800万财政供养人员的事业单位的机构改革也要推进，应逐步取消事业单位的行政级别，改革事业单位行政领导人员任用制。
来自国家行政学院的法学教授应松林代表认为：巩固机构改革的成果，首先要实现政府组织机构和编制法定化，前提是要有完备的法律。他建议新的国务院组织法应该写明国务院的机构设置、人员编制以及政府职能，对违反者应追究其法律责任，以及谁来追究等内容。逐步在全社会形成超编违法、随意设置机构违法的观念。
不少代表反映，省级机构改革面临的最大难题，一是能够吸纳下岗分流干部的空间有限，缓解可能带来的社会震荡的社会承受能力变得相对脆弱；二是如何安置分流干部是一个问题，需要裁减的干部基数很大，涉及到许多人的切身利益，必然会遇到许多阻力。
“两会”代表、委员们从各地带来的信息说，随着政府机构转变职能，社会中介组织在一些地方发展起来了。但有相当一部分则成了“第二政府”，目的是为了藉此增加收入。希望有关方面及早研究这一问题，确保政府机构改革的顺利进行。
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